在一開始學習EndNote的使用時，所學習的文獻匯入方式往往都是建立一個新書目之後，在一項一項的手動輸入，但是這樣的方式會比較耗費時間，在真正進入一個研究主題之後，隨著文線閱讀及接觸的量逐漸增多，會使的文獻管理更加困難。
有一部份的做法是將下載的PDF檔分類建立資料夾存放，需要時再將其書目輸入EndNote使用，但我覺得相比之下，平常就將所有PDF匯入EndNote並建立書目，需要時再取用，會是比較符合效益的做法。
EndNote中，有一項功能是可以透過辨識PDF檔中的DOI碼來建立文獻書目，透過這樣的功能，除了可以快速建立書目外，也可以將PDF檔也存放至其中，再透過登入帳號線上整合，可以在不同台電腦中都同部更新文獻，算是一個我覺得比較便於使用的方式。
(目前確定可用的EndNote版本是16-19版)
